John Duff, eerder de manager van Glendronach distillery, richtte in 1876 Glenlossie op in Elgin. Hij bleef tot 1896 de baas van deze distilleerderij. Hij besloot toen om meer betrokken te raken bij de Longmorn distilleerderij. Een van zijn partners van het eerste uur, H. macKay nam het management van de fabriek over. Deze bleef tot in de 20ste eeuw zeer succesvol. In 1919 werd de Glenlossie stokerij overgenomen door DLC. Na een grote brand in 1929 werd Glenlossie in 1930 overgedaan aan Scottish Malt Distillers. In 1962 werd het aantal ketels van vier naar zes uitgebreid. In 1971 werd er op het terrein een 2e distilleerderij met de naam Mannochmore distillery bijgebouwd. Tot op heden wordt de Glenlossie Distillery gerund door Diageo.
Glenlossie distillerij ligt in het oosten van de Speyside en brengt zelf geen flessen whisky uit. Het dichtst dat daar bij kwam was een uitgifte van Glenlossie in de Diageo serie Flora en Fauna en een speciale editie de Manager's Dram. Enige onafhankelijke bottelaars brengen wel flessen single malt whisky van zowel Glenlossie als Mannachmore op de markt, zoals deze mooie uitgave door Berry Bros & Rudd. Glenlossie was vroeger een belangrijk onderdeel van de Haig's blended whiskies. Tegenwoordig wordt niet meer bekend gemaakt in welke blends deze mooi whisky gebruikt wordt.
Glenlossie haalt al zijn water uit de lokale Bardon Burn. Productie capaciteit is momenteel ca 1,1 miljoen liter pure alcohol per jaar
